Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF5

FAM13B, Protein FAM13B, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13BQ9NYF5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM13BQ9NYF5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM13BQ9NYF5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM13BQ9NYF5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM13BQ9NYF5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms