Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A12Q9NXJ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A12Q9NXJ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms