Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
PDS5BQ9NTI5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PDS5BQ9NTI5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.46■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
PDS5BQ9NTI5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
PDS5BQ9NTI5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PDS5BQ9NTI5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PDS5BQ9NTI5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PDS5BQ9NTI5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PDS5BQ9NTI5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
PDS5BQ9NTI5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PDS5BQ9NTI5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PDS5BQ9NTI5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms