Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMSN1Q9NSI8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMSN1Q9NSI8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMSN1Q9NSI8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms