Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT84Q9NSB2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT84Q9NSB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT84Q9NSB2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms