Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-216ENST00000497930 1156 ntTSL 327.65■■■□□ 2.025e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SGTA-203ENST00000587866 841 ntTSL 527.41■■□□□ 1.985e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-212ENST00000507769 595 ntTSL 327.37■■□□□ 1.975e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-210ENST00000542876 588 ntTSL 327.34■■□□□ 1.975e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 527.25■■□□□ 1.954e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.955e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.915e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-219ENST00000515684 465 ntTSL 326.89■■□□□ 1.95e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-205ENST00000579856 952 ntTSL 526.85■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ITGA1-202ENST00000504086 1366 ntTSL 226.85■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-204ENST00000526319 1906 ntTSL 226.85■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-204ENST00000525611 974 ntTSL 526.84■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-214ENST00000533449 582 ntTSL 326.82■■□□□ 1.885e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.885e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-208ENST00000580423 450 ntTSL 226.76■■□□□ 1.875e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-224ENST00000513544 497 ntTSL 526.68■■□□□ 1.865e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 526.64■■□□□ 1.865e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-216ENST00000572549 663 ntTSL 526.51■■□□□ 1.835e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZNF511-203ENST00000463816 605 ntTSL 526.36■■□□□ 1.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-211ENST00000598707 882 ntTSL 226.34■■□□□ 1.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.815e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.795e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.795e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-225ENST00000575038 832 ntTSL 526.1■■□□□ 1.775e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-230ENST00000576437 1066 ntTSL 526.1■■□□□ 1.775e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-203ENST00000570645 501 ntTSL 526.1■■□□□ 1.775e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-204ENST00000526290 488 ntTSL 325.97■■□□□ 1.755e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAFB2-204ENST00000589925 506 ntTSL 325.81■■□□□ 1.725e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.725e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.715e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.62■■□□□ 1.695e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.695e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-206ENST00000527549 575 ntTSL 225.55■■□□□ 1.685e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.684e-11■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-206ENST00000462780 2420 ntTSL 225.44■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 225.44■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-228ENST00000575850 666 ntTSL 525.41■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-211ENST00000573449 574 ntTSL 325.38■■□□□ 1.655e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 225.24■■□□□ 1.635e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 425.24■■□□□ 1.635e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.624e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 325.16■■□□□ 1.625e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.614e-11■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-213ENST00000489860 934 ntTSL 525.05■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-212ENST00000582744 921 ntTSL 225.02■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.595e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-211ENST00000546202 554 ntTSL 424.94■■□□□ 1.585e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-207ENST00000571480 645 ntTSL 424.9■■□□□ 1.585e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-205ENST00000559406 1799 ntTSL 524.88■■□□□ 1.575e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TMCO3-203ENST00000460039 864 ntTSL 324.86■■□□□ 1.575e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.575e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.565e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-208ENST00000533943 688 ntTSL 324.75■■□□□ 1.555e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)24.56■■□□□ 1.525e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-205ENST00000528529 752 ntTSL 324.53■■□□□ 1.525e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PELO-202ENST00000506949 888 ntTSL 224.27■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-217ENST00000602115 209 ntTSL 324.27■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.475e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.455e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 424.12■■□□□ 1.454e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-209ENST00000537694 882 ntTSL 524.12■■□□□ 1.455e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.446e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-207ENST00000581546 1237 ntTSL 1 (best)23.79■■□□□ 1.45e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MOB2-206ENST00000531976 3174 ntTSL 1 (best)23.61■■□□□ 1.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.364e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.365e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 223.25■■□□□ 1.315e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-211ENST00000479924 930 ntTSL 323.2■■□□□ 1.35e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.285e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-203ENST00000578323 624 ntTSL 522.91■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-205ENST00000570928 540 ntTSL 522.82■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-216ENST00000533817 871 ntTSL 322.82■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-206ENST00000571052 578 ntTSL 422.76■■□□□ 1.235e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SMG9-203ENST00000595700 1401 ntTSL 222.67■■□□□ 1.225e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-204ENST00000578840 912 ntTSL 322.59■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.195e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.195e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 322.36■■□□□ 1.175e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.165e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-218ENST00000514783 2031 ntTSL 1 (best)22.17■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 322.15■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-216ENST00000601778 799 ntTSL 522.12■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-221ENST00000512119 598 ntTSL 321.88■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-213ENST00000481650 549 ntTSL 421.8■■□□□ 1.085e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-205ENST00000527006 412 ntTSL 321.79■■□□□ 1.085e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.085e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LZTS2-206ENST00000481129 745 ntTSL 321.74■■□□□ 1.075e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SGTA-204ENST00000589251 637 ntTSL 321.67■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 46.2
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