Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTFDC1Q9NRG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRTFDC1Q9NRG1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRTFDC1Q9NRG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRTFDC1Q9NRG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms