Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX1Q9NRD9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX1Q9NRD9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX1Q9NRD9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX1Q9NRD9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX1Q9NRD9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX1Q9NRD9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms