Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM10Q9NQV6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM10Q9NQV6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRDM10Q9NQV6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM10Q9NQV6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM10Q9NQV6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM10Q9NQV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM10Q9NQV6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM10Q9NQV6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM10Q9NQV6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms