Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRPM3Q9HCF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM3Q9HCF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM3Q9HCF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM3Q9HCF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms