Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCLRE1BQ9H816 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLRE1BQ9H816 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLRE1BQ9H816 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms