Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf33Q9H7E9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf33Q9H7E9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms