Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SH2D4AQ9H788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2D4AQ9H788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D4AQ9H788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2D4AQ9H788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2D4AQ9H788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2D4AQ9H788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2D4AQ9H788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms