Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RETREG1Q9H6L5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RETREG1Q9H6L5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RETREG1Q9H6L5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RETREG1Q9H6L5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms