Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V8

CDCP1, CUB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP1Q9H5V8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCP1Q9H5V8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCP1Q9H5V8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCP1Q9H5V8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCP1Q9H5V8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms