Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RIBC2Q9H4K1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIBC2Q9H4K1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms