Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMBRA1Q9C0C7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMBRA1Q9C0C7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms