Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP2-4Q9BYR9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms