Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM1Q9BY67 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CADM1Q9BY67 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CADM1Q9BY67 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms