Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFC3Q9BVG8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
KIFC3Q9BVG8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFC3Q9BVG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms