Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK0

MARVELD1, MARVEL domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD1Q9BSK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MARVELD1Q9BSK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MARVELD1Q9BSK0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MARVELD1Q9BSK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MARVELD1Q9BSK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms