Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOTCH4Q99466 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOTCH4Q99466 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms