Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM20AQ96MK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM20AQ96MK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM20AQ96MK3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM20AQ96MK3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms