Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170P1Q96L14 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170P1Q96L14 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP170P1Q96L14 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP170P1Q96L14 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170P1Q96L14 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms