Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A4AQ96JQ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A4AQ96JQ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A4AQ96JQ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MS4A4AQ96JQ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MS4A4AQ96JQ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A4AQ96JQ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 751 ms