Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EAF2Q96CJ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EAF2Q96CJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EAF2Q96CJ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EAF2Q96CJ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EAF2Q96CJ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EAF2Q96CJ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms