Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA10Q969M2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJA10Q969M2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA10Q969M2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms