Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9XQ93008 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP9XQ93008 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms