Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S1Q92572 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S1Q92572 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms