Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPIRE2Q8WWL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPIRE2Q8WWL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE2Q8WWL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIRE2Q8WWL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms