Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMO7Q8WWI1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMO7Q8WWI1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMO7Q8WWI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms