Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBLCP1Q8WVY7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBLCP1Q8WVY7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms