Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGARPQ8TDB4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGARPQ8TDB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MGARPQ8TDB4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGARPQ8TDB4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGARPQ8TDB4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGARPQ8TDB4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGARPQ8TDB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms