Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CADM4Q8NFZ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CADM4Q8NFZ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CADM4Q8NFZ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CADM4Q8NFZ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM4Q8NFZ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CADM4Q8NFZ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CADM4Q8NFZ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms