Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP18Q8NEJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP18Q8NEJ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP18Q8NEJ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP18Q8NEJ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms