Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3C3Q8NEB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PIK3C3Q8NEB9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.7 ms