Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRN4CLQ8ND94 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRN4CLQ8ND94 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRN4CLQ8ND94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRN4CLQ8ND94 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRN4CLQ8ND94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRN4CLQ8ND94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRN4CLQ8ND94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRN4CLQ8ND94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRN4CLQ8ND94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRN4CLQ8ND94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRN4CLQ8ND94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms