Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKVQ8NCB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKVQ8NCB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMKVQ8NCB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMKVQ8NCB2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMKVQ8NCB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMKVQ8NCB2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMKVQ8NCB2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms