Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX3Q8N9I9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DTX3Q8N9I9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms