Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME8Q8N427 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NME8Q8N427 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NME8Q8N427 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms