Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHISA5Q8N114 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA5Q8N114 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA5Q8N114 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms