Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN4Q8IWV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN4Q8IWV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN4Q8IWV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms