Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC5Q8IUR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC5Q8IUR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC5Q8IUR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms