Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACS2Q86VP3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACS2Q86VP3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACS2Q86VP3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms