Protein–RNA interactions for Protein: Q86UL3

GPAT4, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT4Q86UL3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPAT4Q86UL3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAT4Q86UL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms