Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT27Q7Z3Y8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT27Q7Z3Y8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT27Q7Z3Y8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT27Q7Z3Y8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KRT27Q7Z3Y8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KRT27Q7Z3Y8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms