Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT13Q7L8C5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT13Q7L8C5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms