Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf50Q6ZRC1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf50Q6ZRC1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4orf50Q6ZRC1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4orf50Q6ZRC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4orf50Q6ZRC1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf50Q6ZRC1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms