Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDPD4Q6W3E5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDPD4Q6W3E5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDPD4Q6W3E5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms