Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRSAM1Q6UWE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRSAM1Q6UWE0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms